Morphei, вы сделали в срок? Заказчик при приемке заказа увидел косяк или потом?
Если за собой вины не чувствуете (ну чисто по совести), то изматывайте такого клиента бумажками: пусть пишет претензию в 2 экземплярах, потом вы ее рассматриваете в течение 2 недель и выносите заключение, что данный косяк бла-бла-бла в пределах допустимых погрешностей, браком не является, так что это не основание для возврата денег. Если хочет чего-то доказать - пусть идет и делает независимую экспертизу. Вы же в это время пишете ему претензию по поводу того, что он не оплатил заказ. Короче придумывайте как можно больше бумажек. Раз уж клиент решил доипаться до какой-то мелочи, значит, денег вы с него уже не получите. Так хотя бы не отдавайте уже оплаченную сумму. Такая волокита может тянуться месяцами, в результате он просто отвалит. Ну или дойдет до суда, а на суде будет ну очень сложно доказать, что микроскопическая точка может служить основанием для возврата денег.
А вообще, чтобы не быть голословным, выложите скан косяка и оригинал макета. Чтобы уж точно мы приняли вашу сторону. Ну или наоборот.