Когда создаешь модель в арткаме, то там же где указываются ширина и длина модели указывается начало координат. Но не все станки могут это понять. Все зависит от пост процессора. Способен он наэто или нет только пробывать.
Я так понимаю что нужно производить калибровку инструмента когда края уже обработаны?!
Если станок не дает (непонимает) другого начала координат, то выход прост- и в начале обработки и при смене инструмента отводите шпиндель на не обрабатываемую область, отмечаете место где калибровались и потом другой инструмент калибруете в том же месте