у меня было и ИП, и ООО.
Сейчас ООО осталось только на бумаге, закрывать их проблемно достаточно, сдаю нулевые отчеты.
по поводу НДС - ИПшники тоже могут выбрать общую систему налогообложения и платить НДС, но обычно так никто не поступает, себе дороже.