Ну да. Делайте в два слоя.
Круглые углы в макете не обязательно. Будут вырезать или вырубать по контуру.
Два файла наверное должно быть если, один это макет, второй это контур вырубки.
Ну а макеты раскладывать лучше конечно чтобы все макеты были на одном листе. Так дешевле печать будет.
Может получится что каких то макетов на листе будет больше. Тогда печать тиража по макетам которых меньше по количеству получится.