А что все так к стоимости лицензии прицепились? Бумажка, которая за определенную плату дает разрешение на определенный вид деятельности вообще-то называется по-другому. Лицензия, теоретически, вообще может быть бесплатной.
Вот, например, паспорт выдают человеку не за то, что он госпошлину заплатил, а за то что он соответствует критериям, которые дают ему право называться гражданином. Так и тут.