В Акробате Про открываете Инструменты - Допечатная подготовка - Предпечатная проверка. В разделе "Digital printing..." запускаете профиль "Digital printing B/W" (или Color - в данном случае неважно). Только нажимайте Analize, а не Analize and Fix.
В получившемся отчёте ищете строчку "At least one page is empty", где в скобках будет указано, сколько пустых страниц.
Правда если на странице будет белый объект, то она за пустую, скорее всего, не посчитается.
Чтобы не открывать каждый файл отдельно, можно предварительно слить их в один в этом же Акробате.