bubapb, PDF хорош тогда, когда есть Акробат и управление цветом. Без него, это безделушка. Лучше всего подготавливать файлы к печати как говорит sergeiss, только конечную PDF-ку импортировать обратно в CorelDraw и уже оттуда печатать.
p.s. Ваша проблема - это не умение работать в CorelDraw. Что-то намутили со слоями.